协同创新中心按照“需求导向、全面开放、深度融合、创新引领”为原则，设立2个创新平台：“煤炭高效开采与绿色加工”、“煤炭资源与安全开采”，其中“煤炭高效开采与绿色加工”创新平台设在中国矿业大学、“煤炭资源与安全开采”创新平台设在中国矿业大学（北京）。

协同中心根据煤炭行业发展需求，结合中长期发展建设目标，按照“行业总协调、企业提课题、学校组队伍、多方齐保障”的方式，做到以“解决问题、发展产业” 为导向，以“汇聚资源、科学研究”为手段，以“人才培养、提升学科”为目标，对协同体各方进行了明确分工。具体分工如下：

牵头高校：中国矿业大学和中国矿业大学（北京）负责中心建设的组织、运行管理；提供中心2个创新平台的办公场所；组织科研队伍、全球招聘人才、汇聚资源；创新体制机制，为中心开展协同研究、人才培养提供充分、有力的保障，把中心创新平台建成煤炭行业知识创新、重大科学理论和关键技术研究的基地，卓越采矿工程师的培养基地，煤炭高端人才的汇聚洼地。

协同企业：神华集团、中煤能源集团、淮南矿业集团、大同煤矿集团、冀中能源集团负责结合行业需求，提出具体研究任务，并提供科研项目的资金保障；整合企业研发力量，参与协同研究；开放和整合现有科研平台资源，为协同研究提供试验、成果转化应用场所；提供学生的实习实训基地，选派高水平人员指导教学和担任研究生兼职导师。

协同科研院所：中煤科工集团负责结合行业共性及关键性技术需求，提出具体研究任务，并提供科研项目的资金保障；开放和整合现有科研平台资源，为协同研究提供研究测试平台；选派高水平人员指导教学和担任研究生兼职导师。

协同高校：中国矿业大学、中国矿业大学（北京）、辽宁工程技术大学、河南理工大学等8家原煤炭行业高校负责整合本校人力资源，积极参加协同研究；开放、共享本校科研平台资源，为协同研究提供必要的保障；开放整合本校教育资源，全面提高卓越采矿工程师培养质量；通过协同创新，提高本校学生培养质量、提升科学创新能力、促进学科发展。